কোষ বা টিস্যুর পাতলা স্তরকে অণুবীক্ষণ যন্ত্রের নিচে দেখতে গেলে সেই কোষ বা টিস্যুকে কোনো জলীয় দ্রবণে রাখতে হয়। এখন এই জলীয় দ্রবণ থেকে কোষকে আলাদা করে দেখা যায় না। কারণ কোষকে তখন স্বচ্ছ দেখায় এবং এর পাতলা স্তরের প্রতিসরণাঙ্ক পানির প্রতিসরণাঙ্কের কাছাকাছি থাকে। তাই স্টেইনিং করলে সেই কোষ বা তার অঙ্গাণুকে আলাদাভাবে বোঝা যায়।