যে সকল পরমাণু বা পরমাণুগুচ্ছ বা মূলক কোনো জৈব যৌগের অণুর মধ্যে উপস্থিত থেকে ঐ যৌগগুলির ভৌত ও রাসায়নিক ধর্ম নির্ধারণ করে তাদের কার্যকরী মূলক (Functional Groups) বলে। যেমন– অ্যালকোহলের কার্যকরী মূলক হলো হাইড্রক্সিল মূলক (–OH), ফ্যাটি এসিডের কার্যকরী মূলক হলো কার্বক্সিল মূলক (–COOH) ইত্যাদি।