আনবিক গতিবিদ্যা ( এমডি )একটি হল কম্পিউটার সিমিউলেশন বিশ্লেষণের জন্য পদ্ধতি শারীরিক আন্দোলন এর পরমাণু এবং অণুর । পরমাণু এবং অণুগুলিকে একটি নির্দিষ্ট সময়ের জন্য ইন্টারঅ্যাক্ট করার অনুমতি দেওয়া হয় , যা সিস্টেমের গতিশীল "বিবর্তন" এর একটি দৃশ্য দেয়। সবচেয়ে সাধারণ সংস্করণে, নির্দিষ্ট আবক্র পরমাণু এবং অণুর দ্বারা নির্ধারিত হয় সংখ্যাসূচকভাবে সমাধানে নিউটনের গতির সমীকরণ আলাপচারিতার কণার একটি সিস্টেম, যেখানে জন্য বাহিনী কণা এবং তাদের মধ্যে সম্ভাব্য শক্তির প্রায়ই ব্যবহার করে হিসাব করা হয় interatomic সম্ভাবনাবা আণবিক বলবিদ্যা বল ক্ষেত্র . পদ্ধতিটি বেশিরভাগ রাসায়নিক পদার্থবিদ্যা , পদার্থ বিজ্ঞান এবং বায়োফিজিক্সে প্রয়োগ করা হয় ।
একটি সাধারণ সিস্টেমে একটি আণবিক গতিবিদ্যা সিমুলেশনের উদাহরণ: তামার একটি ঠান্ডা স্ফটিকের উপর একটি তামা (Cu) পরমাণুর জমা ( মিলার ইনডেক্স (001) পৃষ্ঠ )। প্রতিটি বৃত্ত একটি পরমাণুর অবস্থান উপস্থাপন করে। উপরের দিক থেকে আসা পরমাণুর গতিশক্তি অন্যান্য পরমাণুর মধ্যে পুনরায় বিতরণ করা হয়, তাই পরমাণুর মধ্যে আকর্ষক শক্তির কারণে এটি বাউন্স করার পরিবর্তে সংযুক্ত থাকে।
আণবিক গতিবিদ্যা সিমুলেশনগুলি প্রায়ই বায়োফিজিকাল সিস্টেমগুলি অধ্যয়ন করতে ব্যবহৃত হয়। এখানে জলের একটি 100 পিএস সিমুলেশন চিত্রিত করা হয়েছে।
আদর্শ আণবিক গতিবিদ্যা সিমুলেশন অ্যালগরিদমের একটি সরলীকৃত বিবরণ, যখন একটি ভবিষ্যদ্বাণীকারী-সংশোধক-টাইপ ইন্টিগ্রেটর ব্যবহার করা হয়। শক্তিগুলি হয় শাস্ত্রীয় আন্তঃপরমাণু সম্ভাবনা থেকে আসতে পারে (গাণিতিকভাবে বর্ণনা করা হয়েছে এভাবে{\displaystyle F=-\nabla V({\vec {r}})}) বা কোয়ান্টাম মেকানিক্যাল (গাণিতিকভাবে বর্ণনা করা হয়েছে এভাবে {\displaystyle F=F(\Psi ({\vec {r}}))}) পদ্ধতি। বিভিন্ন ইন্টিগ্রেটরের মধ্যে বড় পার্থক্য বিদ্যমান; কিছুতে ফ্লো চার্টে নির্দেশিত একই সর্বোচ্চ-ক্রমের পদ নেই, অনেকে উচ্চ-অর্ডার টাইম ডেরিভেটিভ ব্যবহার করে, এবং কিছু পরিবর্তনশীল-সময় পদক্ষেপ স্কিমে বর্তমান এবং পূর্ববর্তী উভয় ধাপ ব্যবহার করে।
যেহেতু আণবিক সিস্টেমগুলি সাধারণত বিপুল সংখ্যক কণা নিয়ে গঠিত, তাই বিশ্লেষণাত্মকভাবে এই ধরনের জটিল সিস্টেমের বৈশিষ্ট্যগুলি নির্ধারণ করা অসম্ভব ; MD সিমুলেশন সংখ্যাসূচক পদ্ধতি ব্যবহার করে এই সমস্যাটি দূর করে । যাইহোক, দীর্ঘ MD সিমুলেশনগুলি গাণিতিকভাবে অসুস্থ , সাংখ্যিক একীকরণে ক্রমবর্ধমান ত্রুটি তৈরি করে যা অ্যালগরিদম এবং পরামিতিগুলির সঠিক নির্বাচনের মাধ্যমে হ্রাস করা যেতে পারে, কিন্তু সম্পূর্ণরূপে নির্মূল করা যায় না।
যে সিস্টেমগুলি এরগোডিক হাইপোথিসিস মেনে চলে তাদের জন্য, একটি আণবিক গতিবিদ্যা সিমুলেশনের বিবর্তন সিস্টেমের ম্যাক্রোস্কোপিক থার্মোডাইনামিক বৈশিষ্ট্যগুলি নির্ধারণ করতে ব্যবহার করা যেতে পারে : একটি এরগোডিক সিস্টেমের সময়ের গড়গুলি মাইক্রোক্যানোনিকাল এনসেম্বল গড়গুলির সাথে মিলে যায় । MD-কে "সংখ্যা দ্বারা পরিসংখ্যানগত বলবিদ্যা" এবং " নিউটনিয়ান মেকানিক্সের ল্যাপ্লেসের দৃষ্টিভঙ্গি " বলা হয়েছে যা প্রকৃতির শক্তিকে অ্যানিমেট করে ভবিষ্যতের ভবিষ্যদ্বাণী করে [1] এবং পারমাণবিক স্কেলে আণবিক গতির অন্তর্দৃষ্টির অনুমতি দেয়।
source :উইকিপিডিয়া