যখন বহিরাগত ব্যাকটেরিয়া দেহের মূত্রথলি ও মূত্রনালীতে প্রবেশ করে সংক্রমণ ঘটায় তখন সেটি ব্যাকটেরিয়াল সিস্টাইটিস নামে পরিচিত। এছাড়াও মানবদেহের পরিপাকতন্ত্রে অবস্থিত ব্যাকটেরিয়াগুলো যখন নিজেদের মধ্যকার ভারসাম্য হারিয়ে ফেলে তখনও ব্যাকটেরিয়াল সিস্টাইটিস হতে পারে।
তাই যখনই মূত্রথলির সংক্রমণ দেখা যাবে তখনই চিকিৎসা নেওয়া অত্যাবশ্যক নতুবা সংক্রমণ কিডনি পর্যন্ত ছড়িয়ে যেতে পারে।